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科研進(jìn)展

叢堯研究組發(fā)展YISEL亞基中位標(biāo)簽定位方法并首次實(shí)現(xiàn)TRiC/CCT各亞基在其開環(huán)結(jié)構(gòu)中的精確定位

來源: 時(shí)間:2018-02-11
        2月5日,國際學(xué)術(shù)期刊Scientific Reports在線發(fā)表中國科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所叢堯研究組的最新研究成果“Development of a yeast internal-subunit eGFP labeling strategy and its application in subunit identification in eukaryotic group II chaperonin TRiC/CCT”。該項(xiàng)工作發(fā)展了酵母亞基中位eGFP標(biāo)簽定位(YISEL)方法,并結(jié)合冷凍電鏡三維重構(gòu),首次明確了TRiC各亞基在其開環(huán)結(jié)構(gòu)中的定位,也為其他超大分子復(fù)合體的亞基準(zhǔn)確定位提供了新策略。
 
        細(xì)胞中蛋白質(zhì)的正確折疊對維持細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)態(tài)具有重要作用。真核細(xì)胞中的分子伴侶素TRiC/CCT可以協(xié)助約10%的胞質(zhì)蛋白正確折疊,其功能的缺失與癌癥和神經(jīng)退行性疾病等密切相關(guān)。TRiC由8種不同的亞基組成雙環(huán)背對背堆疊結(jié)構(gòu),且有特定的亞基排列方式。TRiC各亞基具有不同的底物結(jié)合能力、ATP結(jié)合以及水解能力,研究其亞基排布方式對于深入理解其結(jié)構(gòu)與功能至關(guān)重要。由于TRiC亞基同源但又各不相同,且高分辨率結(jié)構(gòu)信息有限,其亞基的空間排布一直存在爭議。
 
        叢堯研究員帶領(lǐng)博士研究生臧云祥及碩士研究生王胡萍等實(shí)驗(yàn)室成員,發(fā)展了YISEL(yeast internal-subunit eGFP labeling)方法,利用酵母同源重組方法分別在CCT1、CCT2、CCT4、CCT5、CCT6、CCT7亞基的氨基酸序列中間(非N-或者C-末端)插入eGFP標(biāo)簽。通過解析上述帶有eGFP標(biāo)簽的TRiC冷凍電鏡結(jié)構(gòu),最終確定了各亞基在其開環(huán)結(jié)構(gòu)中的準(zhǔn)確定位,解決了一直以來的爭議。YISEL方法也為其他超大分子復(fù)合體的亞基準(zhǔn)確定位提供了新策略。
 
        該工作得到生化與細(xì)胞所周金秋和周兆才研究員的支持。該研究得到國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(上海)冷凍電鏡系統(tǒng)、數(shù)據(jù)庫與計(jì)算分析系統(tǒng)、質(zhì)譜系統(tǒng)、核磁系統(tǒng)、顯微鏡系統(tǒng)與規(guī)?;鞍踪|(zhì)制備系統(tǒng)的大力支持;并得到國家自然科學(xué)基金委、國家科技部、中國科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)(B類)、上海大科學(xué)中心高端用戶項(xiàng)目以及中國科學(xué)院重大科技基礎(chǔ)設(shè)施開放研究項(xiàng)目等的資助。
 
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YISEL方法示意圖及其在TRiC亞基定位中的應(yīng)用

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