生化與細(xì)胞所科研人員用系統(tǒng)生物學(xué)方法首次揭示代謝性手術(shù)治療糖尿病的轉(zhuǎn)歸路徑
來源:
時間:2018-03-19
2月, EBioMedicine這份由 Cell Press 和 Lancet聯(lián)合出版的新的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)刊物上,發(fā)表了一項由中國科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所系統(tǒng)生物學(xué)重點實驗室吳家睿、曾嶸、陳洛南研究組與丹麥哥本哈根大學(xué)Jens J. Holst研究組的合作研究 “Systems Signature Reveals Unique Remission-path of Diabetes Generated by Gastric Bypass Surgery”,系統(tǒng)揭示了代謝性手術(shù)治療糖尿病的轉(zhuǎn)歸途徑。
“代謝性手術(shù)”源于目的為減輕體重的“減重手術(shù)”,作為肥胖癥的一種治療手段。研究者進而發(fā)現(xiàn),減重手術(shù)對2型糖尿病治療也有顯著療效,在美國克利夫蘭醫(yī)療中心2013年公布的十大醫(yī)療創(chuàng)新榜上,代謝性手術(shù)治療糖尿病位列榜首。許多國家糖尿病臨床指南已明確指出,代謝性手術(shù)治療應(yīng)成為肥胖糖尿病患者的標(biāo)準(zhǔn)治療選擇之一。
一個隨之而來的困惑是:代謝性手術(shù)治療糖尿病究竟是減重的伴隨結(jié)果,還是有獨立于減重的分子機制?如果后者成立,那么相關(guān)的分子機制也可以應(yīng)用于治療非肥胖糖尿病,從而使更多患者受益。此次發(fā)表的這項工作,從系統(tǒng)生物學(xué)的角度對這個問題給出了一個全新的答案。
首先,研究人員對肥胖糖尿病患者和血糖正常的非糖尿病肥胖個體進行了
胃旁路手術(shù);然后分別在手術(shù)前和手術(shù)后(1周、3個月和1年),提取每個患者餐前餐后共12個時間點的血漿及詳盡的臨床數(shù)據(jù)。隨后,基于時間序列的連續(xù)樣本,研究人員同時采集了血漿蛋白質(zhì)組和代謝物組數(shù)據(jù)。進一步,研究人員發(fā)展了基于“邊”的網(wǎng)絡(luò)計算理論和方法。由此發(fā)現(xiàn):肥胖糖尿病患者(DO)和非糖尿病肥胖個體(NO)的治愈路徑有明顯的區(qū)別,兩個人群在康復(fù)后的分子網(wǎng)絡(luò)狀態(tài)是更加遠(yuǎn)離,而不是接近。也就是說,代謝性手術(shù)治療糖尿病有著獨立于減重的分子途徑,這對于糖尿病的治療無疑是一個好消息。
研究者進一步對這些個體的蛋白質(zhì)與代謝物相互作用的分子網(wǎng)絡(luò)中主要連接點(Hub)進行了深入的分析。結(jié)果表明,非糖尿病肥胖個體和肥胖糖尿病患者表現(xiàn)出的術(shù)后恢復(fù)路徑之差別,可以從其生物分子網(wǎng)絡(luò)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和重構(gòu)過程得到很好的解釋。代謝性手術(shù)可以使得機體的生理狀態(tài)發(fā)生系統(tǒng)重建,正是這樣整體性的重建,使得糖尿病和肥胖得以治愈。而非糖尿病肥胖個體和肥胖糖尿病患者網(wǎng)絡(luò)重建的途徑,速度和模式皆不相同。這一發(fā)現(xiàn)提供了治療代謝性疾病的若干潛在靶點,也表明代謝性疾病的治愈是基于網(wǎng)絡(luò)重構(gòu)的多靶點作用機制,而非控制單靶點就能達(dá)到理想的治療效果,這為代謝性疾病的治療提供了新的思路。
這一研究工作的創(chuàng)新點在于:過去研究者往往關(guān)注的是各個分子的濃度變化,可以視為“點(node)”的分析;而在該項研究中,研究人員的關(guān)注點則是這些分子兩兩之間的變化關(guān)系,并為此發(fā)展了一種新的計算方法對這些分子間的關(guān)系進行分析和構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò),可以稱為“邊(Edge)”的分析。作為“邊”的生物分子之間的關(guān)系不僅更加穩(wěn)定,而且由邊形成的網(wǎng)絡(luò)更反映了整體的生理狀態(tài),這也正是系統(tǒng)生物學(xué)的要義之一。
該研究工作的另外一個特色是:把多組學(xué)數(shù)據(jù)(如蛋白質(zhì)組和代謝組)整合在一起進行分析。從系統(tǒng)生物學(xué)的角度來看,基因、蛋白質(zhì)和代謝物都是機體生物分子網(wǎng)絡(luò)不可分割的組成成分,彼此之間有著緊密的關(guān)系和相互影響,基于邊的網(wǎng)絡(luò)算法也使得這種整合成為可能。
這項研究工作從臨床監(jiān)測到組學(xué)數(shù)據(jù)采集再到網(wǎng)絡(luò)計算,是一個多學(xué)科中外合作的成果。該工作受到丹麥諾和諾德公司與中科院聯(lián)合設(shè)立的前糖尿病中心的長期支持,是學(xué)術(shù)界與工業(yè)界合作進行轉(zhuǎn)化研究的成功范例。該項工作還受到中科院先導(dǎo)專項,科技部重大研究計劃的支持。

非糖尿病肥胖個體和肥胖糖尿病患者在代謝性手術(shù)前后的分子路徑迥異


非糖尿病肥胖個體 (NO)和肥胖糖尿病患者 (DO)代謝性手術(shù)前后的分子“節(jié)點(Hub)”網(wǎng)絡(luò)