叢堯研究組揭示酵母組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶COMPASS復(fù)合體的完整結(jié)構(gòu)
來(lái)源:
時(shí)間:2018-12-07
11月27日,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊
Scientific Reports在線(xiàn)發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所叢堯研究組的最新成果
“Architecture and subunit arrangement of the complete
Saccharomyces cerevisiae COMPASS complex”。該工作首次解析了完整的酵母組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶COMPASS復(fù)合體的冷凍電鏡結(jié)構(gòu),揭示了其亞基排布方式,為進(jìn)一步研究COMPASS復(fù)合體催化組蛋白H3K4甲基化的機(jī)制提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
組蛋白H3第四位賴(lài)氨酸(H3K4)的甲基化在DNA轉(zhuǎn)錄、修復(fù)等過(guò)程中起重要作用,酵母中該過(guò)程由組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶COMPASS復(fù)合體催化完成。該復(fù)合體從酵母到人高度保守。存在六種人源COMPASS復(fù)合體(MLL1-4/COMPASS, SET1A/COMPASS和SET1B/COMPASS),其亞基或功能的缺失或突變將引起白血病、腫瘤等諸多人類(lèi)疾病。該類(lèi)復(fù)合體組成復(fù)雜且極具動(dòng)態(tài)性和構(gòu)象不均一性,給結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究帶來(lái)極大挑戰(zhàn),至今尚無(wú)完整結(jié)構(gòu)。
叢堯研究員指導(dǎo)助理研究員王艷興及博士后丁占玉等實(shí)驗(yàn)室成員,在酵母細(xì)胞中超表達(dá)了包括全部7個(gè)亞基的COMPASS復(fù)合體,并首次解析了完整COMPASS復(fù)合體的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)。綜合應(yīng)用該實(shí)驗(yàn)室自行發(fā)展的復(fù)合體亞基中位標(biāo)簽定位方法YISEL及YISPANL(JMB,2018;Sci Rep, 2018)聯(lián)合冷凍電鏡結(jié)構(gòu)解析,并結(jié)合交聯(lián)質(zhì)譜(XL-MS)測(cè)定(由黃超蘭研究員、黃敏工程師完成),確定了COMPASS復(fù)合體的亞基排布方式及其作用網(wǎng)絡(luò)。該研究提出了COMPASS復(fù)合體結(jié)合底物核小體催化H3K4甲基化的潛在分子機(jī)制,并為研究相關(guān)人源COMPASS復(fù)合體的完整結(jié)構(gòu)及功能奠定基礎(chǔ)。
該研究得到大阪大學(xué)Junichi Takagi教授,生化與細(xì)胞所周金秋、周兆才和陳勇研究員,上海交通大學(xué)黃晶和雷鳴教授,以及中科院生物物理所許瑞明研究員的大力支持;同時(shí)得到國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)研究(上海)設(shè)施冷凍電鏡系統(tǒng)、數(shù)據(jù)庫(kù)與計(jì)算分析系統(tǒng)、質(zhì)譜系統(tǒng)及規(guī)?;鞍踪|(zhì)制備系統(tǒng)的設(shè)備支持。該研究獲國(guó)家自然科學(xué)基金委、國(guó)家科技部及中國(guó)科學(xué)院資助。

完整酵母COMPASS復(fù)合體的結(jié)構(gòu)研究。(A)COMPASS復(fù)合體冷凍電鏡三維結(jié)構(gòu);(B)COMPASS各亞基排布示意圖