李典范研究組通過優(yōu)化脂質組成結晶脂質代謝跨膜酶
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時間:2020-03-18
3月12日,中國科學院生物化學與細胞生物學研究所李典范研究組在Crystal Growth & Design上發(fā)表最新研究成果“In Meso Crystallization of the Integral Membrane Glycerol 3-phosphate Acyltransferase with Substrates”,發(fā)現(xiàn)甘油單酯的脂肪鏈的長度和雙鍵位置對膜蛋白PlsY晶體的衍射質量至關重要,PlsY蛋白與脂溶性和水溶性底物的共結晶對脂肪鏈長存在選擇性。
脂立方相是膜蛋白結構生物學研究中的重要結晶前沿技術,但該方法所獲得的晶體往往較小并難以優(yōu)化。通過篩選不同長度的脂肪鏈,發(fā)現(xiàn)與9.9 MAG(脂肪鏈含18個碳原子)相比,7.8 MAG(15個碳原子)和7.9 (16個碳原子)MAG更適合于PlsY蛋白的結晶,并能衍射到高分辨率。在PlsY與其脂底物?;姿岬墓步Y晶中,7.8 MAG是必需的。但是,在PlsY與水溶性底物甘油3-磷酸的共結晶中,7.8 MAG不能產生復合物晶體,而9.9 MAG卻能支持其結晶。由此推測,在結合口袋位于膜邊界的情況下,長脂肪酸的脂質因為能形成柔性相對較小的脂雙層結構而更能穩(wěn)定膜蛋白與配體的結合。
李典范組實驗員李振建和研究生湯艷楠是本文的共同第一作者。該研究工作得到了中科院前沿局、中科院重大科技基礎設施開放研究項目、基金委以及上海市科委等的經(jīng)費支持。

PlsY的脂立方相晶體優(yōu)化
通過優(yōu)化蛋白質構建、脂肪鏈組成和溫度,獲得甘油3-磷酸脂酰轉移酶的結構及其與底物、產物的共晶體結構