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科研進展

周小龍組與王恩多組合作揭示人線粒體tRNA牛磺酸修飾酶GTPBP3催化GTP水解及其缺陷導(dǎo)致線粒體疾病的分子機制

來源: 時間:2021-02-26

  2月22日,國際學(xué)術(shù)期刊Nucleic Acids Research在線發(fā)表了中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)周小龍研究組與王恩多研究組合作研究成果“The human tRNA taurine modification enzyme GTPBP3 is an active GTPase linked to mitochondrial diseases”。

  tRNA分子是細(xì)胞內(nèi)所有RNA分子中,轉(zhuǎn)錄后修飾最為密集、修飾種類最為繁多的RNA分子。其中,發(fā)生在反密碼子環(huán)第34位(Wobble 位)的修飾種類最為多樣,調(diào)控反密碼子-密碼子配對的強度與廣度,在遺傳信息傳遞中精確調(diào)控基因表達。盡管三界生物共有多數(shù)tRNA修飾,但某些修飾,卻局限在特定物種或細(xì)胞器中。例如,尿嘧啶?;撬嵝揎?τm5U) ,只發(fā)生在哺乳動物線粒體5種tRNA第34位,包括線粒體tRNALeu(UUR)以及tRNALys。進化分析提示,人GTPBP3 (hGTPBP3)以及人MTO1 (hMTO1)負(fù)責(zé)協(xié)同催化生成τm5U,且可能依賴hGTPBP3介導(dǎo)的GTP水解反應(yīng),但具體機制不詳。τm5U修飾缺陷直接導(dǎo)致多種人類重大疾病。線粒體tRNALeu(UUR)基因A3243G突變造成τm5U修飾缺陷,導(dǎo)致MELAS (線粒體腦肌病伴乳酸中毒及中風(fēng)樣發(fā)作綜合征);線粒體tRNALys A8344G突變造成τm5U修飾缺陷,導(dǎo)致MERRF (肌陣攣性癲癇伴隨紅纖維病);hGTPBP3、hMTO1突變導(dǎo)致先天性心臟病等。但長期以來,τm5U修飾從未被成功重組,致使這些突變致病的生化機制完全未知。西班牙一個研究組先前報道人hGTPBP3沒有GTPase活力,使得人線粒體tRNA τm5U修飾及hGTPBP3突變導(dǎo)致疾病的機制更加令人費解。

  本研究中,研究人員發(fā)現(xiàn)hGTPBP3以二聚體存在,建立了測定GTPase 活性的最適反應(yīng)條件,首次證實hGTPBP3是一個有活力的GTPase,并測定了其酶反應(yīng)動力學(xué)常數(shù)。通過體外生化分析,發(fā)現(xiàn)hGTPBP3單獨的G結(jié)構(gòu)域和缺失N-端結(jié)構(gòu)域的hGTPBP3的GTPase活力很低,但是仍可二聚化。構(gòu)建了一系列hGTPBP3致病突變體,細(xì)胞實驗表明某些突變體通過泛素化途徑降解,導(dǎo)致蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)水平顯著降低;體外酶動力學(xué)數(shù)據(jù)揭示,除了E459K突變體外,其它突變體的GTPase活力都顯著下降。酵母遺傳學(xué)互補實驗顯示僅D337H突變體可以維持酵母生長,表明其它致病突變影響體內(nèi)tRNA的修飾,進而影響酵母的生長。進一步的研究表明,R3L突變會阻礙蛋白質(zhì)進入線粒體;E142-R136和E159-R431之間的相互作用對hGTPBP3的結(jié)構(gòu)和功能至關(guān)重要。此外,還發(fā)現(xiàn)了一個新的定位于細(xì)胞質(zhì)的hGTPBP3同源異形體,命名為hGTPBP3-Iso7,暗示其在細(xì)胞質(zhì)中有尚未揭示的新功能。

  本研究首次證實hGTPBP3是一個有活力的GTP水解酶;建立了hGTPBP3水解GTP的詳細(xì)機制;闡釋了hGTPBP3基因上一系列致病點突變導(dǎo)致先天性心臟病的生化與細(xì)胞基礎(chǔ);發(fā)現(xiàn)了一個新穎的定位于細(xì)胞質(zhì)的hGTPBP3同源異形體。以上研究結(jié)果為進一步成功重組τm5U修飾活力、闡明τm5U修飾機制、揭示發(fā)生在核基因組以及線粒體基因組中τm5U修飾缺陷導(dǎo)致相關(guān)人類疾病的分子機制奠定基礎(chǔ)。

  分子細(xì)胞卓越中心與上海科技大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士研究生彭桂鑫為本文第一作者,周小龍研究員和王恩多研究員為本文共同通訊作者。分子細(xì)胞卓越中心李青潤博士、上海交大醫(yī)學(xué)院許泓教授參與了該研究;該研究得到了分子細(xì)胞卓越中心胡榮貴研究員、浙江大學(xué)管敏鑫教授的大力支持。該工作得到了科技部國家重點研發(fā)計劃、基金委、中科院、上海市的經(jīng)費資助。

  文章鏈接

 

 

hGTPBP3通過催化GTP水解介導(dǎo)線粒體tRNA第34位τm5U修飾

hGTPBP3基因通過mRNA可變剪接產(chǎn)生定位于細(xì)胞質(zhì)的Iso7同源異形體(功能未知);定位于線粒體的hGTPBP3與hMTO1相互作用介導(dǎo)τm5U修飾。一系列致病點突變導(dǎo)致hGTPBP3線粒體定位喪失、泛素化降解、GTPase活力下調(diào)等,影響τm5U修飾水平,進而導(dǎo)致呼吸鏈活性及線粒體穩(wěn)態(tài)失衡。

 
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