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科研進展

陳玲玲研究員受邀在Molecular Cell發(fā)表環(huán)形RNA翻譯Preview文章

來源: 時間:2021-10-21

  10月21日,中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心(生物化學與細胞生物學研究所)陳玲玲研究員受邀在國際學術期刊Molecular Cell發(fā)表了題為“Expanded regulation of circular RNA translation”文章,對同期同刊發(fā)表的環(huán)形RNA翻譯相關研究工作進行了導讀和展望。

  外顯子反向剪接來源的環(huán)形RNA是共價、閉環(huán)、單鏈的RNA分子。美國斯坦福大學醫(yī)學院Howard Y. Chang研究組通過大規(guī)模篩選鑒定了一系列可驅(qū)動環(huán)形RNA翻譯的internal ribosome entry site(IRES,核糖體進入位點)元件,并對產(chǎn)生的部分多肽進行了驗證及功能闡釋。該研究于2021年10月21日發(fā)表于Molecular Cell。

  環(huán)形RNA雖然在哺乳動物細胞中普遍表達,但通常表達量較低且呈組織和細胞特異性。雖然已有報道發(fā)現(xiàn)小部分內(nèi)源環(huán)形RNA可以在細胞內(nèi)翻譯多肽,環(huán)形RNA翻譯產(chǎn)生的多肽功能尚不明確。在該工作中,研究人員建立了一種可翻譯表達綠色熒光蛋白質(zhì)eGFP的環(huán)形RNA翻譯篩選系統(tǒng),鑒定到約17,000個可驅(qū)動環(huán)形RNA翻譯的候選IRES元件,并對發(fā)現(xiàn)的系列IRES元件驅(qū)動環(huán)形RNA翻譯進行研究,發(fā)現(xiàn)IRES中具有一定二級結(jié)構(gòu)的SuRE(structured RNA element)元件和18S rRNA互補序列均可促進環(huán)形RNA翻譯。進一步的,通過對現(xiàn)有環(huán)形RNA數(shù)據(jù)庫分析,結(jié)合多肽組學及質(zhì)譜鑒定,研究人員捕獲了124個與內(nèi)源環(huán)形RNA開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF)相一致的多肽,其中15個多肽序列跨越環(huán)形RNA特有的反向剪接位點,說明這些多肽確定為環(huán)形RNA翻譯產(chǎn)生。最后,研究人員以FGFR1基因編碼的環(huán)形RNA翻譯產(chǎn)生的多肽circFGFR1p為例,發(fā)現(xiàn)這種缺失FGFR1 酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域的多肽circFGFR1p能夠與細胞內(nèi)FGFR1蛋白質(zhì)相互作用抑制細胞增殖;此外,這種調(diào)控在細胞熱休克應激條件下更加明顯,揭示了低表達的環(huán)形RNA翻譯產(chǎn)生的多肽在細胞應激條件下發(fā)揮功能的分子機制。該工作不僅系統(tǒng)研究了驅(qū)動環(huán)形RNA翻譯元件及調(diào)控機制,也為利用環(huán)形RNA翻譯的特性在體外作為新型基因表達平臺提供借鑒。

  陳玲玲研究員為本文的通訊作者,陳玲玲研究組博士后劉楚霄為本文的第一作者。

  文章鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276521007760 

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